1、稅務抽查，稅務每年都會按比例隨機抽查一部分企業的賬目， 隨機抽查也分為定向抽查和不定向抽查。定向抽查一般按照稅務稽查對象類型、經營規模、收入規模、納稅數額、成本利潤率、稅負率、稅收風險等級、納稅信用級別等特定條件等特定條件，不定向抽查不設定條件，通過搖號確定待查對象名單。
2、按照風險管理工作流程推送的高風險納稅人風險信息分析選取的抽查對象，還有就是上級稅務局安排的隨機抽查計劃和打擊偷稅、逃避追繳欠稅、騙稅、抗稅、虛開發票等稽查任務。
3、企業被舉報了，如果你的企業偷稅漏稅別人舉報了，企業也會被稅務稽查，企業存在經營不規范、做假賬，或有偷漏稅嫌疑，如果被相關的人員掌握了信息并向稅務實名舉報，證據比較充分、事實也比較清楚的話，那么稅務稽查也會對企業進行立案調查。
4、有很多企業被稅務稽查是因為虛開發票，金稅三期上線后，別再相信虛開一兩張發票不會被查，稅務利用大數據，即使你虛開一張發票也會被查。如果你虛開的發票上游企業被查，那么你也會跟著被查。如果企業發票的進項與銷項不一致，就有虛開的嫌疑。
5、有一些企業為了虛增費用，虛列工人工資，尤其是一些小企業，把一些親戚朋友的身份證錄入自己企業虛列工資。新的個稅申報系統上線后，企業再這樣虛列工資，小心被稅務預警。
6、未開票收入不申報，一定要及時的進行納稅申報繳納稅款。企業應該以增值稅納稅義務發生的時間確認實際收入并申報納稅，納稅人未按照規定期限繳納稅款的，扣繳義務人未按照規定期限解繳稅款的，稅務機關除責令限期繳納外，從滯納稅款之日起，按日加收滯納稅款萬分之五的滯納金。