全面營改增之后，作為個人所得稅、企業所得稅、房產稅、土地增值稅等稅種的計稅依據或者計稅收入，顯然應為不含增值稅收入，這當然毫無疑問。但有時候，在計算不含增值稅收入時，則會產生一些異議。
一、增值稅減免時的不含稅收入
我們舉例來講：甲公司（一般納稅人，向住建設部門開業報備、從事住房租賃經營業務）2021年10月向個人出租住房，取得（含增值稅）租金50000元。甲公司選擇適用簡易計稅方法，按照5%的征收率減按1.5%計算繳納增值稅。
甲公司應納增值稅額=50000÷（1+5%）×1.5%=714.29元
關于這個計算過程，本身沒有問題；這在“國家稅務總局公告2016年第16號”等文件有明確規定。
那么，在計算房產稅時，這個不含稅收入怎么計算呢？
公式一：
不含稅收入=50000÷（1+5%）=47619.05元
公式二：
不含稅收入=50000-714.29=49285.71元
顯然，二者是有差異的；事實上，就是差在增值稅免征的那個3.5%上。
那么，依據哪個數字計算房產稅呢？我們來看“財稅〔2016〕43號”文件規定，免征增值稅的，確定計稅依據時，成交價格、租金收入、轉讓房地產取得的收入不扣減增值稅額。
也就是說，對于免征的這“3.5%的增值稅”，在計算房產稅時，是不作扣減的。即應當采用公式二，以49285.71元作為房產稅計稅依據。
注（一）：個體工商戶、其他個人出租住房，也是適用“按照5%的征收率減按1.5%計算繳納增值稅”。
我們再來看一個土地增值稅的情況。
二、關于土地增值稅預征依據
例如：乙公司房地產開發企業，一般納稅人，2021年10月預售所開發的商品房，取得預收房款（含增值稅）1000萬元，增值稅適用一般計稅方法。
乙公司應預繳增值稅=1000÷（1+9%）×3%=27.52萬元
注（二）：房地產開發企業銷售其自行開發的商品房，增值稅預征率是3%。
那么，乙公司對于上述預收款項，應當以什么金額作為預繳土地增值稅的計算依據呢？同樣，這兒也是有兩個公式，而產生爭議。
公式一：
不含稅收入=1000÷（1+9%）=917.43萬元
公式二：
不含稅收入=1000-27.52=972.48萬元
首先，我們說，公式二也是有個文件依據。
“國家稅務總局公告2016年第70號”規定，房地產開發企業采取預收款方式銷售自行開發的房地產項目的，可按照以下方法計算土地增值稅預征計征依據：
土地增值稅預征的計征依據=預收款-應預繳增值稅稅款
然而，曾經有人提出過，此文件關于上述公式，使用了“可”這個措辭。也就是說，并非強制必然這樣計算；那么，依照公式一行不行呢？
這個問題可能存在一定爭議，有待進一步明確吧。