增值稅稅率先后經歷了多次調整，并且后期稅率都是低于原增值稅稅率。后期需要補開原稅率發票一般是基于以下情形：一是一般納稅人在稅率調整前開具的發票有誤需要重新開具，且已按照原適用稅率開具了紅字發票，現重新開具正確的藍字發票。二是一般納稅人在稅率調整前發生增值稅應稅銷售行為，且已申報繳納稅款但未開具增值稅發票，現需要補開原適用稅率增值稅發票。三是轉登記納稅人在一般納稅人期間開具的適用原稅率發票有誤需要重新開具，且已按照原適用稅率開具了紅字發票，現重新開具正確的藍字發票。四是轉登記納稅人在一般納稅人期間發生增值稅應稅銷售行為，且已申報繳納稅款但未開具增值稅發票，現需要補開原適用稅率增值稅發票。
一般納稅人需要開具原稅率發票，應向主管稅務機關提交《開具原適用稅率發票承諾書》，辦理臨時開票權限。臨時開票權限有效期限為24小時，納稅人應在獲取臨時開票權限的規定期限內開具原適用稅率發票。增值稅發票稅控開票軟件稅率欄次默認顯示調整后稅率，一般納稅人可以手工選擇原適用稅率開具增值稅專用發票。
補開原增值稅稅率發票，一般來說納稅人已按原增值稅稅率繳納了增值稅，后期補開原稅率增值稅專用發票后，在增值稅申報時，按原增值稅稅率應稅項目，按照申報表調整前后的對應關系，分別填寫相關欄次。比如：銷售的貨物，將金額、稅額填入所屬期的《增值稅納稅申報表附列資料(一)》第1行“13%稅率的貨物及加工修理修配勞務”“開具增值稅專用發票”相關列次。同時，由于原適用16%稅率的銷售額已經在前期按照未開具發票收入申報納稅，本期應當在《增值稅納稅申報表附列資料(一)》第1行“13%稅率的貨物及加工修理修配勞務”“未開具發票”相關列次填寫相應負數進行沖減。
當然，納稅人補開原稅率發票，但在之前并未按照原稅率申報繳納增值稅的，則應當加收滯納金。