一般來說，一般納稅人應當一般計稅，即以銷項減進項的余額為應納稅額。但一般納稅人發生增值稅法規定的特定應稅行為，可以選擇簡易計稅方法計稅。在實務中，對一般納稅人選擇簡易計稅或一般計稅存在以下八點誤區：
誤區之一：選擇一般計稅后不能轉回簡易計稅。
除國家稅務總局另有規定外，納稅人一經認定為一般納稅人后，不得轉為小規模納稅人。但一般納稅人屬于增值稅法規定的可選擇簡易計稅項目，選擇了一般計稅，是否可以轉為簡易計稅呢？現行政策并無禁止性規定，只要是符合簡易計稅的條件和范圍，一般計稅和簡易計稅之間是可以相互轉換的。即企業可以將一般計稅方式變更為簡易計稅方式。需要注意的是，某些地區可能有特定的政策規定，例如江西省稅務局規定，在提供建筑服務或銷售自行開發的房地產項目時，如果符合簡易計稅條件，應當直接選擇簡易計稅，否則適用一般計稅以后不得再改為簡易計稅方法計稅。因此，在考慮變更計稅方式時，企業應咨詢當地的稅務機關，了解具體的政策要求。
誤區之二：一般計稅變為簡易計稅受36個月制。
根據《營業稅改征增值稅試點實施辦法》（財稅〔2016〕36號）第十八條的規定，一般納稅人發生應稅行為適用一般計稅方法計稅。一般納稅人發生財政部和國家稅務總局規定的特定應稅行為，可以選擇適用簡易計稅方法計稅，但一經選擇，36個月內不得變更。從上述政策看出，選擇簡易計稅方法計稅的，如果要變更為一般計稅方式要等36個月。反之，一般計稅變更為簡易計稅則不受36個月的限制，可以隨時由一般計稅轉為簡易計稅。
誤區之三：轉為一般計稅之前的進項稅一律不得抵扣。
根據《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）附件2 規定：不得抵扣且未抵扣進項稅額的固定資產、無形資產、不動產，發生用途改變，用于允許抵扣進項稅額的應稅項目，可在用途改變的次月按照下列公式計算可以抵扣的進項稅額：可以抵扣的進項稅額=固定資產、無形資產、不動產凈值/（1+適用稅率）×適用稅率。注意：上述可以抵扣的進項稅額應取得合法有效的增值稅扣稅憑證。適用稅率為取得增值稅專用發票上注明的稅率或征收率。沒有取得扣稅憑證的仍不能抵扣。
另據《國家稅務總局關于納稅人認定或登記為一般納稅人前進項稅額抵扣問題的公告》（國家稅務總局公告2015年第59號）規定，如果小規模納稅人在辦理稅務登記至認定或登記為一般納稅人期間未取得生產經營收入，且未按照銷售額和征收率簡易計算應納稅額申報繳納增值稅的，那么在此期間取得的增值稅扣稅憑證，可以在認定或登記為一般納稅人后抵扣進項稅額。因此，如果小規模納稅人在上述條件滿足的情況下取得了增值稅專用發票，那么這些發票在小規模納稅人期間是不能用于抵扣的。但一旦轉為一般納稅人，這些專用發票就可以用來抵扣進項稅。
誤區之四：同一業務不能選擇性適用一般計稅或簡易計稅。
同一業務是否可以選擇性一般計稅和簡易計稅，取決于具體情況：一般情況下，小規模納稅人發生應稅行為時適用簡易計稅方法。但對于一般納稅人，如果發生財政部和國家稅務總局規定的特定應稅行為，也可以選擇適用簡易計稅方法。在一個建筑企業中，不同的工程項目可以選擇不同的計稅方法。例如，有的項目可以選擇一般計稅，而另一個項目可以選擇簡易計稅。但對于同一個工程項目的不同部分，通常只能選擇一種計稅方法。對于企業來說，可以根據不同的經營行為選擇不同的計稅方法。例如，銷售取得的不動產時，如果有兩個交易行為存在選擇空間，可以一個選擇簡易計稅方法，另一個選擇一般計稅方式。綜上所述，同一業務在不同情況下可以選擇一般計稅和簡易計稅中的一種，但具體選擇需根據財稅政策和企業的實際情況來確定。
誤區之五：轉為一般計稅之前銷售的貨物適用一般計稅。
根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》（國令第691號）第十九條的規定，增值稅納稅義務發生時間為收訖銷售款項或者取得索取銷售款項憑據的當天。因此在適用簡易計稅期發生的應稅行為，應按照納稅義務發生的時間來界定是否可以選擇簡易計稅。所以，簡易計稅期間實現的增值稅應稅收入仍可以簡易計稅。當然，轉為一般計稅之前所銷售的貨物并非一定發生增值稅納稅義務。比如采取賒銷方式銷售貨物，根據增值稅暫行條例實施細則的規定，采取賒銷方式銷售貨物，為書面合同約定的收款日期的當天，無書面合同的或者書面合同沒有約定收款日期的，為貨物發出的當天。因此，賒銷合同約定的收款時間為轉為一般計稅之后，應當適用一般計稅。但是否適用“老合同老辦法”呢？這個也是有先例，比如根據《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》(財稅〔2016〕36號)的規定，轉租業務屬于不動產租賃服務，需要繳納增值稅。對于一般納稅人而言，如果所轉租的房產是在2016年4月30日之前取得的，那么可以選擇適用簡易計稅方法，按照5%的征收率計算應納稅額。如果所轉租的房產是在此之后取得的，則不能選擇簡易計稅方法。針對轉為一般計稅之前銷售的貨物，并且是納稅義務發生在轉為一般計稅之后能否簡易計稅，需要與稅務機關溝通。注意：轉為一般計稅后，對簡易計稅期間銷售的貨物已發生增值稅納稅義務，可以選擇簡易計稅，并且可以開具簡易計稅發票，但對簡易計稅期間未按時繳納的增值稅應當加收滯納金。
誤區之六：一般計稅轉為簡易計稅，之前企業購入的固定資產、無形資產、不動產已經抵扣增值稅，需要做進項稅額轉出。
根據《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）規定，只有專用于簡易計稅項目的固定資產、無形資產、不動產的進項稅是需要轉出，如果既用于一般計稅又用于簡易計稅的，這種不是專門用于簡易計稅的固定資產、無形資產、不動產的進項稅不用進項稅轉出。
誤區之七：銷售簡易計稅期間取得的固定資產可以選擇簡易計稅。
銷售簡易計稅期間取得的固定資產區分有形動產和不動產，是否可以簡易計稅也區分情況：
（一）一般納稅人處置用于簡易計稅的有形動產。《財政部 國家稅務總局關于部分貨物適用增值稅低稅率和簡易辦法征收增值稅政策的通知》（財稅〔2009〕9號）等規定：一般納稅人銷售自己使用過的屬于條例第十條規定不得抵扣且未抵扣進項稅額的固定資產，按照簡易辦法依照3%征收率減按2%征收增值稅。《國家稅務總局關于一般納稅人銷售自己使用過的固定資產增值稅有關問題的公告》（國家稅務總局公告2012年第1號）規定，納稅人購進或者自制固定資產時為小規模納稅人，認定為一般納稅人后銷售該固定資產可按簡易辦法依3%征收率減按2%征收增值稅。
需要注意的，這里的固定資產，不是會計上的固定資產，增值稅上有特定的含義。《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》（財政部國家稅務總局令2008年第50號）第二十一條規定：固定資產，是指使用期限超過12個月的機器、機械、運輸工具以及其他與生產經營有關的設備、工具、器具等。《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）第二十八條規定：固定資產，是指使用期限超過12個月的機器、機械、運輸工具以及其他與生產經營有關的設備、工具、器具等有形動產。增值稅上的固定資產僅指有形動產，不包括不動產，在條款表述上將固定資產、不動產作為并列的概念，不同于會計概念。
（二）一般納稅人處置用于簡易計稅的不動產。《營業稅改征增值稅試點有關事項的規定》（財稅〔2016〕36號）附件2規定：一般納稅人銷售其2016年4月30日前取得（不含自建）的不動產，可以選擇適用簡易計稅方法，以取得的全部價款和價外費用減去該項不動產購置原價或者取得不動產時的作價后的余額為銷售額，按照5%的征收率計算應納稅額。一般納稅人銷售其2016年4月30日前自建的不動產，可以選擇適用簡易計稅方法，以取得的全部價款和價外費用為銷售額，按照5%的征收率計算應納稅額。一般納稅人銷售其2016年5月1日后取得的不動產，應適用一般計稅方法，以取得的全部價款和價外費用為銷售額計算應納稅額。從上述政策分析，全面營改增后，處置不動產，是根據不動產取得時間來確定是否可以簡易計稅。對于2016年5月1日后取得（含自建）的不動產，不區分用途及是否抵扣，均不得簡易計稅，需要按一般計稅方法計算增值稅。同時，根據《營業稅改征增值稅試點有關事項的規定》：按照《增值稅暫行條例》第十條不得抵扣且未抵扣進項稅額的固定資產、無形資產、不動產，發生用途改變，用于允許抵扣進項稅額的應稅項目，可在用途改變的次月按照下列公式，依據合法有效的增值稅扣稅憑證，計算可以抵扣的進項稅額：可以抵扣的進項稅額=固定資產、無形資產、不動產凈值/〔1+適用稅率）×適用稅率。上述可以抵扣的進項稅額應取得合法有效的增值稅扣稅憑證。
誤區之八：屬于簡易計稅項目可以任意選擇一般計稅或簡易計稅。
一般納稅人發生增值稅法規定的特定應稅行為，可以選擇適用簡易計稅方法計稅，但也有例外即只能選擇簡易計稅的情形。比如《財政部 國家稅務總局關于建筑服務等營改增試點政策的通知》（財稅〔2017〕58號）第一條規定：建筑工程總承包單位為房屋建筑的地基與基礎、主體結構提供工程服務，建設單位自行采購全部或部分鋼材、混凝土、砌體材料、預制構件的，適用簡易計稅方法計稅。由此可見，甲供工程適用簡易計稅應同時具備如下五個條件：一是甲供工程適用簡易計稅的主體必須是工程總承包單位，專業分包單位和勞務分包單位均不適用，專業分包和勞務分包，由總承包單位給分包單位提供全部或部分設備、材料、動力，此時分包工程可以視為總、分包單位之間的甲供工程,可以選擇適用簡易計稅方法，也可以選擇一般計稅；二是必須是房屋建筑工程，對承包的市政、公路等工程均不適用；三是工程必須是地基與基礎、主體結構這兩類；四是必須是“建筑服務-工程服務”，安裝、修繕、裝飾等建筑服務均不適用；五是“甲供”必須是鋼材、混凝土、砌體材料、預制構件等四類材料中的一種或多種，列舉之外的其他材料設備均不適用。也就是說，只要同時滿足上述五項條件的，無論建設單位甲供比例為多少，建筑企業針對本工程只能適用簡易計稅方法計稅。